韩国国内的部分，网友提出《太子妃升职记》小说作者鲜澄「嫌韩」，原因是作者另一部作品《和亲公主》里多次用「高丽棒子」一词贬低高丽使节，剧情描写也对高丽文化相当不尊重。虽然导演表示只用了「现代男灵魂穿越到王后身上」的设定，但仍有网友不买帐，留言「偏偏买嫌韩作家的作品」、「买之前应该要调查一下」、「不想看嫌韩作家赚韩国的钱」。（延伸阅读：《太子妃升职记》原著作者疑似嫌韩）  再者，《哲仁王后》不选择架空历史，而是大胆地把时空背景放在哲宗时期，主要角色包括哲仁王后、哲宗、纯元王后……等等均为真实历史人物，让许多人相当担心《哲仁王后》扭曲了历史。果不其然，开播后各种情节遭到批判，例如美化哲宗沉迷酒色的形象，主角张奉焕眼见与史实不符，还说：「《朝鲜王朝实录》不过也只是小传闻嘛！」轻视被视为韩国国宝的《朝鲜王朝实录》。网友直呼剧组「缺乏历史意识」、「更动真实历史疯了吗？」还有网友留言：「这部电视剧比起厌韩作家写的原作，厌韩元素更多了」。  《哲仁王后》还被指责情节呈现过於露骨，即第2集赵大妃（神贞王后）积极授予中殿怀孕的妙招，比了各种手势最后以马赛克播出来，有网友甚至觉得此行为涉及「性骚扰」。神贞王后后代丰壤赵氏宗亲会也出面表示：「从人物介绍开始，（神贞王后）就以『相信各种迷信』的角色出现，所以正在考虑如何应对，虽然是喜剧，但还是造成了对现实人物的侮辱，我们深表遗憾、将强力应对。」