未来世界，克隆技术与记忆储存移植技术成为人们打开永生之门的钥匙。人们在躯体衰亡前，克隆自己的身体，以备在死后将自己的记忆移植到新的躯体来继承意识，以此实现永生。为以防万一，除了拥有主意识的克隆体外，人们还会克隆简化的数量不等的备份副本，这些备份克隆体拥有部分的记忆且可能出现一定的退化现象，其不继承主意识，通常只用于劳动力、器官移植和长期储存。

三代Emily与四代David相爱，但四代David却在某天突然猝死，于是三代Emily提取并保存了他的全部记忆在自己脑中。

副本9号Emily从三代Emily的记忆中了解到: 三代David的副本4号会因为爱上三代Emily，而想杀掉有主意识的四代David取而代之。于是，她设法穿越时空给过去的初代David留下了关于时光穿梭的技术，并将埋藏地的坐标告诉了初代David，让他设法在他的未来阻止副本4号。初代David 经过一番冒险与漫长的等待终于获得时光穿越的技术，他也因垂老而选择死亡，并制造了有主意识的二代David和2号、3号两个克隆体副本。

二代David利用时光机成功穿越到未来副本4号杀死四代David的现场，并杀掉了副本4号。然而，他随即被穿越而来的副本3号杀死。而副本3号又被随后而来的副本2号杀死。接着，副本2号杀死了四代David。副本2号回到原时间点，取代了二代David，并克隆了自己，清除了克隆体与时光穿越有关的大部分记忆，是为三代David。

三代David制造了4、5号克隆体副本，彼时时空穿越技术虽然已经存在，但还是非公开的秘密技术。副本4号获得了这项非公开的秘密技术并成为了“清除者”。“清除者”可以自由穿越时间，任务是通过暗杀保证时间线的稳定。副本4号在执行任务的过程中爱上了三代Emily ，嫉妒让他决定杀死四代David并取而代之。他将心思写入日记，结果被三代David知晓。但三代David无法获得穿越时空的技术来阻止副本4号。于是，三代David决定潜心研究时光穿越技术，甚至因实验把副本5号传送到了不知哪个时空，但终究没能获得成功。三代David决定以静态管技术沉睡百年，寄希望于未来穿越时空普及，可以让他阻止副本4号。沉睡让三代David的智力衰退，当他醒来时，他将一个年轻没有记忆的副本放在博物馆中展览，取名为“时间是生物的监牢”。在未知的时间地点，三代David制造了四代David ，并留下遗言：“死亡不是目的地，死亡是没了目的地”，之后就在尘世销声匿迹，不知所踪（我强烈怀疑四代David很可能就是副本5号，在第一部中三代Emily提到过四代David存在很多缺陷，很可能是因为他是副本的副本）。

四代David 没有继续三代David 的研究，似乎也遗忘了要阻止副本4号的任务。之后，四代David和三代Emily 相爱结婚，但他们的好时光匆匆地终结于四代David的猝死。副本9号Emily因为三代Emily保存的四代David的记忆而爱上了这个从未谋面的男人，于是为了阻止4号副本David 杀死四代David，她给初代David留下时光穿梭技术，并埋藏于一颗废弃的矿星上，将坐标通过神经网络穿越时空传递给过去的初代David。

而副本2号David扫描了副本9号Emily留给初代David的记录，找到了她留下记录的矿星的时间与空间坐标。他穿越而去，和正在埋藏记录的副本9号Emily 相遇。